Các giả thiết thay thế xếp hoặc Atlantogenata và Boreoeutheria, hoặc Afrotheria và Exafroplacentalia (Notolegia) vào gốc của cây phát sinh chủng loài:

Atlantogenata

Một phân tích năm 2012 gợi ý rằng gốc của Eutheria nằm giữa Atlantogenata và Boreoeutheria[6]. Một phân tích Bayes năm 2013 cũng cho rằng giả thuyết Atlantogenata có ưu thế hơn so với 2 giả thuyết kia.[7].

Exafroplacentalia

Giả thiết Exafroplacentalia hay Notolegia được đề xuất năm 2001 trên cơ sở nghiên cứu phân tử[3][8].

Exafroplacentalia đặt Xenarthra làm nhóm chị em với Boreoeutheria (gồm Laurasiatheria và Euarchontoglires)[9].